Liittymällä TLKS:n jäseneksi, liityt samalla automaattisesti myös SML:n jäseneksi. Medisiinariliitto valvoo jäsentensä etuja muun muassa ottamalla kantaa lääketieteen opiskelijoita koskettaviin aiheisiin, kuten lääketieteellisten koulutusohjelmien sisäänottomääriin, kandidaattien työskentelyyn opintojen ohella ja peruskoulutuksen kehittämiseen. Näiden lisäksi SML palkitsee vuosittain työpaikkoja ja terveyskeskuksia kandiystävällisyydestä sekä valitsee Vuoden opetusteon ja syväriohjaajan.

SML:n ylin päättävä elin on kahdesti vuodessa kokoontuva liittokokous eli liittarit. Liittarit järjestetään vuoron perään Suomen lääkiskaupungeissa. Liittokokousedustajaksi voi ilmoittautua kuka tahansa jäsenseuran jäsen, ja edustuspaikkojen lukumäärä määräytyy jäsenseuran jäsenmäärän perusteella. Käytännön toimintaa johtaa liiton hallitus, joka valitaan syksyisin liittokokouksessa. TLKS:stä hallitukseen valitaan vuosittain kaksi paikallisedustajaa.